Основы реализации методов молекулярного механики

Данный курс ставит своей целью познакомить слушателей с базовой реализацией методов молекулярной динамики и, в меньшей степени, Монте-Карло. Основной особенностью данного курса будет сопровождение обсуждаемого теоретического материала программным кодом на языке Python, что позволит слушателям точнее понимать тонкости реальных расчетов, подводные камни.

В курсе будут подняты такие следующие вопросы:
1. Силовые поля. Методы их генерации из QM расчетов.
2. Суммирование сил, метод Эвальда, мультипольный метод.
3. Термостатирование и баростатирование в методе МД.
4. Алхимические подходы: термодинамическое интегрирование и FEP.

Курс требует от слушателей знание основ алгоритмов и языка Python.